国际口腔医学杂志 ›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (1): 55-58.doi: 10.7518/gjkq.2013.01.015

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宏基因组学及其在口腔微生物研究领域中的应用

陆剑 李宇红 杜民权   

  1. 口腔基础医学省部共建国家重点实验室培育基地和口腔生物医学教育部重点实验室,武汉大学口腔医学院   武汉 430079
  • 收稿日期:2012-02-20 修回日期:2012-08-27 出版日期:2013-01-01 发布日期:2013-01-01
  • 通讯作者: 杜民权, Tel: 027-87686227
  • 作者简介:陆剑(1983—),男,湖北人,主治医师,硕士
  • 基金资助:

    国家自然科学基金资助项目(81170954)

The research methods of metagenomic and the application of metagenomic study in the oral microbiota

Lu Jian, Li Yuhong, Du Minquan.   

  1. The State Key Laboratory Breeding Base of Basic Science of Stomatology(Hubei- MOST) & Key Laboratory of Oral Biomedicine Ministry of Education, School and Hospital of Stomatology, Wuhan University, Wuhan 430079, China.
  • Received:2012-02-20 Revised:2012-08-27 Online:2013-01-01 Published:2013-01-01

摘要:

宏基因组学研究特定生物环境中全部微小生物的基因组,直接从土壤和海水以及人体胃肠道和口腔等环境中获取样品DNA,利用适宜的载体将其克隆到替代宿主细胞中构建宏基因文库,以筛选新的活性物质和新的基因;因此,利用宏基因组学技术不仅能够有效地检测口腔微生物群落结构,同时还极大地扩展了口腔微生物资源的利用空间,增加了获得新的生物活性物质和基因的机会。本文就宏基因组学的研究方法和宏基因组学口腔微生物研究领域中的应用等研究进展作一综述。

关键词: 宏基因组学, 微生物群落, 遗传物质, 口腔

Abstract:

Metagenomics is the genomes of the total microbiota found in nature. Metagenome libraries were constructed by directly extracting DNA from environmental samples, Such as soil, oceans, human gastrointestinal tract and mouth, etc., and transforming to surrogate host. The libraries were screened for novel bioactive compounds or genes. Therefore, Metagenomics can effectively detect oral microbial community structure, and also can enormously amplified the space of microbial resource utilization and enhanced the opportunity of obtain novel bioactive compounds. This review included the research progress of the methods of metagenomic and the application of metagenomic study in the oral microbiota.

Key words: metagenomics, microorganism structure, genetic materialoral

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