国际口腔医学杂志 ›› 2015, Vol. 42 ›› Issue (6): 703-709.doi: 10.7518/gjkq.2015.06.021

• 综述 • 上一篇    下一篇

微生物代谢组学的研究策略及其在人体微生物中的应用

余培 薛晶 李伟   

  1. 口腔疾病研究国家重点实验室 华西口腔医院(四川大学) 成都 610041
  • 收稿日期:2015-04-08 修回日期:2015-07-18 出版日期:2015-11-01 发布日期:2015-11-01
  • 通讯作者: 薛晶,副主任医师,博士,Email:jing_xue_scu@163.com
  • 作者简介:余培,硕士,Email:475105847@qq.com

Research strategies of microbial metabolomics and its application in human microbes

Yu Pei, Xue Jing, Li Wei.   

  1. State Key Laboratory of Oral Diseases, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu 610041, China
  • Received:2015-04-08 Revised:2015-07-18 Online:2015-11-01 Published:2015-11-01

摘要:

微生物代谢组学诞生于1992年,其研究一般包括样本采集、样本检测和数据分析。早期,微生物代谢组学主要用于不同菌株特性的生物学鉴定;目前,代谢组学技术已应用于微生物表型分类、突变体筛选,代谢途径和微生物代谢工程,发酵工程监控和优化,微生物环境污染物等方面。在口腔医学领域,微生物代谢组学技术在微生物鉴定以及龋病、牙周病、唇腭裂和口腔肿瘤研究中皆有应用,最多的还是用于口腔中的致龋菌和牙周致病菌代谢产物的分析。微生物代谢组学技术可以很好地检测出不同菌株间的差异,因而有望成为口腔微生物快速鉴定的新技术。本文就微生物代谢组学的研究策略及应用进展作一综述并提出未来研究中面临的难题。

关键词: 代谢组学, 微生物, 质谱, 磁共振, 口腔

Abstract:

Microbial metabolomics began in 1992, and research on this field includes sample collection, sample testing, and data analysis. Early microbial metabolomics is mainly utilized for the biological identification and characterization of different strains. At present, metabolomics has been applied to microbial phenotypic classification, mutant screening, metabolic pathway and metabolic engineering, control and optimization of fermentation engineering and microbial contaminants, and so on. In dentistry, microbial metabolomics technology has been applied in microbial identification, dental caries, periodontal disease and oral cancer, and cleft lip and palate. Analysis of cariogenic bacteria and periodontal pathogen metabolites in the oral cavity is a common practice. Given its accuracy in differentiating different strains, microbial metabolomics technology is expected to become a new technique for the rapid identification of oral microorganisms. This paper reviews the progress in the study of microbial strategies and applications of metabolomics and presents the problems that may be faced in future studies.

Key words: metabolomics, microorganism, mass spectrometry, magnetic resonance, dentistry

中图分类号: 

  • R 780.2
[1] 孔利心,任彪,程磊. 环氧合酶2/前列腺素E2通路调控口腔肿瘤机制的研究进展[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(4): 431-438.
[2] 于林彤,宋光泰. 铒激光在儿童口腔医学中的应用[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(3): 351-355.
[3] 易俭如,罗梦奇,尹一佳,刘治清,柳茜,石永乐,杨征,刘帆,韩向龙. 新型冠状病毒肺炎流行期降低口腔诊疗中气溶胶传播风险的策略[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(3): 362-365.
[4] 郝福,宁毅,孙睿,郑晓旭. 口腔鳞状细胞癌中转化因子2β的表达及潜在的临床意义[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(2): 159-165.
[5] 薛伶俐,李雅冬. 经首次根治性手术治疗口腔鳞状细胞癌患者的生存相关影响因素分析[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(2): 166-174.
[6] 田青鹭,赵志河. 微型种植体在口腔正畸中稳定性的研究进展[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(2): 212-218.
[7] 魏中武,黄谢山,陈灼庚. 浓缩生长因子在口腔临床中的应用及研究进展[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(2): 235-243.
[8] 毕小琴,熊茂婧,陈丽先,白沅艳,田莉,杨晖. 新型冠状病毒肺炎疫情下口腔颌面外科的护理防控[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(2): 244-248.
[9] 张明爽,巴特,王文标. 口腔微生物种群与阿尔茨海默病相关发病机制的研究进展[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(1): 102-108.
[10] 崔钰嘉,孙建勋,周学东. 黄连素的生物学功能及治疗口腔疾病研究的进展[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(1): 115-120.
[11] 董云梅,陶艳,周瑜. 口腔黏膜癌变过程中血清生化标志物的研究进展[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(1): 43-50.
[12] 陈煜鑫,周瑜,陈谦明. 口腔苔藓样病变的研究进展[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(1): 51-57.
[13] 沈晨露,叶伟佳,吕柯佳,高碧聪,姚华. 口腔扁平苔藓实验模型建立的研究进展[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(1): 58-62.
[14] 黄璐,戴杰,吴燕岷. 唾液生物标志物在口腔癌筛查中的应用[J]. 国际口腔医学杂志, 2020, 47(1): 68-75.
[15] 陈宏丽,杨敬,尹刚,李皓缘,乔燕. 锌指蛋白32在口腔鳞状细胞癌中的表达意义及对口腔鳞状细胞癌干细胞的影响[J]. 国际口腔医学杂志, 2019, 46(6): 631-639.
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed   
[1] 王昆润. 二甲亚砜和双氯芬酸并用治疗根尖周炎[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(06): .
[2] 汤庆奋,王学侠. 17β-雌二醇对人类阴道和口腔颊粘膜的渗透性[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(06): .
[3] 潘劲松. 颈总动脉指压和颈内动脉球囊阻断试验在大脑血液动力学中的不同影响[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(05): .
[4] 王昆润. 后牙冠根斜形牙折的治疗[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(05): .
[5] 杨锦波. 嵌合体防龋疫苗的研究进展[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(05): .
[6] 王昆润. 下颔骨成形术用网状钛板固定植骨块[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(04): .
[7] 汪月月,郭莉莉. 口腔机能与老化—痴呆危险因素流行病学研究[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(04): .
[8] 丁刚. 应用硬组织代用品种植体行丰颏术[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(04): .
[9] 田磊. 局部应用脂多糖后结合上皮反应性增生的变化[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(04): .
[10] 戴青. 口腔念珠菌病的新分类[J]. 国际口腔医学杂志, 1999, 26(04): .